植物乳桿菌WCFS1和JDM1的糖代謝PPI網絡魯棒性研究
摘要:由于生長環境不同,植物乳酸桿菌WCFS1和JDM1的糖代謝存在差異。為研究兩者糖代謝差異,本文利用復雜網絡理論,構建植物乳酸桿菌WCFS1和JDM1糖代謝的蛋白質-蛋白質相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)網絡。通過研究兩者糖代謝PPI網絡的魯棒性,發現在隨機攻擊、度攻擊、介數攻擊三種方式下, WCFS1的檸檬酸循環模塊、戊糖磷酸途徑模塊的PPI網絡的魯棒性優于JDM1,較JDM1有較強的容錯性。此外,發現WCFS1和JDM1的糖代謝PPI網絡受介數高的節點影響較大。
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