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基于生物信息學分析和預測人骨肉瘤中Gab2靶向作用的miRNA分子

張蕊; 吳啟洋; 劉紀明; 郭曉儀; 吳龍火 贛南醫學院藥學院制藥工程教研室; 江西贛州341000; 贛南醫學院; 江西贛州341000

摘要:目的:通過生物信息學軟件分析和預測在人骨肉瘤中能夠靶向結合Gab2的miRNA。方法:首先通過生物信息學軟件mir Walk 2. 0預測可以靶向結合Gab2的miRNA,然后用miRanda得到Gab2-miRNA的熱力學穩定性評分和序列保守性評分。并通過人骨肉瘤miRNA芯片GSE70367得到在人骨肉瘤中差異表達的miRNA。在生物信息學軟件打分較高的miRNA中選出差異表達的miRNA,從而選出人骨肉瘤中能與Gab2結合的特異性最強,穩定性最高的miRNA。結果:mir Walk 2. 0預測有22個miRNA可與Gab2靶向結合;其中,miR-1236-3p、miR-218-5p與Gab2結合的穩定性和特異性最好;在人骨肉瘤中差異表達的miRNA有184個,而miR-218-5p的表達也存在差異性,并且表達下調。結論:在人骨肉瘤中miR-218-5p可能靶向結合于Gab2,Gab2是miR-218-5p的靶基因。

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