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亞洲棉ARF基因家族全基因組鑒定與分析

馮庭; 司國陽; 李國輝; 郭寧; 蔡永萍 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 合肥230036

摘要：生長素響應(yīng)因子(ARF)是植物中可以特異性結(jié)合生長素應(yīng)答基因啟動子的轉(zhuǎn)錄因子,在植物的生長發(fā)育中起著重要的調(diào)控作用。為了更好的了解亞洲棉中ARF基因家族的種類和數(shù)量,本文利用生物信息學(xué)的方法,分析了亞洲棉基因組中ARF基因的種類、進(jìn)化關(guān)系、物理定位以及基因的結(jié)構(gòu)和保守基序。結(jié)果表明在亞洲棉基因組中發(fā)現(xiàn)并初步確定了29個ARF基因,命名為GaARF,通過基因定位發(fā)現(xiàn)除在2、3、5、11號染色體上沒有ARF基因外,其他染色體上都有ARF基因存在;而且在10號染色體上還存在著基因簇;進(jìn)化樹分析表明,亞洲棉部分ARF蛋白和已知功能的擬南芥聚類到一起;表達(dá)模式分析顯示,不同組織不同處理條件下ARF基因的表達(dá)存在差異。

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