谷子分蘗相關QTL定位及緊密連鎖標記開發
摘要：分蘗是與農作物產量相關的重要農藝性狀之一,分蘗對于谷子產量的提高具有重要意義,但是目前谷子分蘗遺傳分子機制還不清楚。利用簡化基因組測序技術(RAD-seq),以2個F2群體(命名為Cross AJ和Cross HC)為研究對象,分別對2個F2群體的543個和131個單株及其親本進行RAD-seq,利用MSTmap和WinQTLCart2.5軟件進行遺傳圖譜構建和QTL分析,結果共鑒定出8個控制分蘗相關的QTL。其中,利用Cross AJ共鑒定了6個QTL,分別為qAJTN1、qAJTN5、qAJTN7-1、qAJTN7-2、qAJTN7-3和qAJTN9,可解釋表型變異0.7%~9.8%;利用Cross HC群體共鑒定了2個QTL,分別為qHCTN5和qHCTN7,可解釋表型變異1.4%~8.3%。在這8個QTL中,qAJTN1、qAJTN5、qAJTN7-2、qAJTN9和qHCTN5為該研究新鑒定的位點,其余3個QTL(qAJTN7-1、qAJTN7-3和qHCTN7)與前人研究結果相一致。另外,通過將親本的測序結果與參考基因組進行比對,搜索插入缺失位點InDel(Insertion-deletion),新開發了谷子分蘗相關QTL(qAJTN7-3和qHCTN7)緊密相關的InDel標記。結果為谷子分蘗機制的研究奠定一定基礎,所開發的分子標記對于分蘗型谷子的分子標記輔助育種具有重要意義。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系華北農學報雜志社
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