MBL2與MASPs家族蛋白質相互作用的生物信息學分析
摘要：目的:通過生物信息學方法對甘露糖結合凝集素2(MBL2)蛋白與甘露聚糖結合凝集素相關絲氨酸蛋白酶(MASPs)家族蛋白質的相互作用進行全面預測分析。方法:使用同源建模(Swiss-model)和折疊識別(Phyre2)分別來構建MBL2蛋白與MASPs家族蛋白質的結構,使用STRING數據庫及ZDOCK3.02預測分析MBL2與MASP1、MASP2兩個蛋白質的相互作用情況。結果: MBL2與MASP1和MASP2均存在直接相互作用,并且和COLEC11、COLEC10、FCN2、C4B等構成相互作用網絡。MBL2與MASP1結合位點和MASP2的結合位點高度重疊。MBL2參與結合MASP1的殘基,大部分(77%)也參與了與MASP2的結合,表明MBL2是通過同一個區域,分別與MASPs家族的蛋白質相互作用。結論: MBL2與MASPs家族蛋白質之間作用密切,從而可能在補體系統激活及機體免疫防御等方面發揮重要的作用。
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