向日葵Hsp70基因家族成員的全基因組鑒定與生物信息學分析
摘要：熱激蛋白70 (heat shock protein 70, Hsp70)是細胞應對高溫和其它逆境脅迫時所產生的一類分子伴侶類型應激蛋白。本研究以向日葵(Helianthus annuus)基因組數據庫為基礎,利用生物信息學方法對其Hsp70基因家族成員進行鑒定和分析。結果表明,向日葵共有103個Hsp70基因家族成員,根據亞細胞定位結果可分為5種不同類型,分析了不同成員編碼蛋白的理化性質。系統進化分析結果顯示,HaHsp70基因家族成員分為9個分支,每個分支成員的結構和功能相對保守。根據MEME軟件進行保守基序分析,并鑒定了103個基因家族成員在向日葵17條染色體上的數量及分布情況,其中以15號染色體上分布最多,而11號染色體沒有成員分布。轉錄本結構分析展示了不同基因成員內含子以及外顯子的結構情況。本研究結果有助于了解向日葵Hsp70基因家族成員的情況,進而為進一步研究向日葵Hsp70基因家族成員的功能分析提供基礎。
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