廣東省10株乙型腦炎病毒的分子特征研究
摘要：了解廣東省目前流行的乙型腦炎病毒的基因型別,以及新分離毒株與P3和SA14-14-2疫苗株E蛋白的氨基酸差異,推測疫苗株的可能保護效果。本研究對廣東省2017年從蚊蟲和蠓蟲標本分離的10株乙型腦炎病毒基因組序列測定,利用MEGA軟件登錄GenBank下載乙型腦炎病毒代表株序列并繪制進化樹,同時用ClustalW2軟件與疫苗株進行氨基酸同源性比對和E蛋白的序列分析。10株乙型腦炎病毒均屬基因I型GI-b組,但分別位于2個不同的、小的進化分枝中。10株新分離病毒與P3和SA14-14-2疫苗株的E蛋白氨基酸同源性分別位于97.40%~97.60%和97.20%~97.40%之間。E基因區段500個氨基酸中,P3株與新分離乙型腦炎病毒株之間共存在17個氨基酸位點的差異(包括12個共同氨基酸的改變),略高于SA14-14-2疫苗株的16個氨基酸位點變異(包括11個共同氨基酸的改變)。其中在DI區的P3和SA14-14-2株分別有1個和3個共同氨基酸變異,DⅡ區各有5個共同氨基酸改變,DⅢ區分別有5個和2個共同氨基酸改變,結構域之外各有1個共同氨基酸的變異。絕大多數變異發生在非關鍵位點,只在E306和E388處觀察到的氨基酸位點變異與疫苗P3株關鍵位點的改變有關,這兩個位點(G306E,E388G)均發生在DⅢ區,而疫苗SA14-14-2未觀察到關鍵位點的改變。總之,廣東省流行的乙型腦炎病毒基因型別可能已由Ⅲ型變為I型;疫苗SA14-14-2株及P3株與新分離毒株均具有很高的同源性,絕大多數關鍵氨基酸位點未發生變異,對新分離病毒均具有良好的免疫保護價值。
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