三帶喙庫蚊中分離的西藏環(huán)狀病毒全基因序列測定及分析
摘要:西藏環(huán)狀病毒(Tibet orbivirus,TIBOV)是環(huán)狀病毒屬中的新成員,首次分離自中國西藏自治區(qū)的圓斑按蚊,本研究首次對(duì)從三帶喙庫蚊標(biāo)本中分離到的西藏環(huán)狀病毒(HN11121株)進(jìn)行全基因組序列測定和分子遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果顯示除第2節(jié)段以外,三帶喙庫蚊分離的HN11121病毒株與從圓斑按蚊分離的西藏環(huán)狀病毒原始分離株(XZ0906)第1~10節(jié)段核苷酸和其編碼的氨基酸序列長度相同,核苷酸和氨基酸同源性分別為70.3%(S6)~98.7%(S5)和79.8%(S6)~99.8%(S10);而HN11121病毒株與XZ0906病毒株第2節(jié)段核苷酸長度分別為2 850bp和2 838bp,分別編碼950和946個(gè)氨基酸,核苷酸和氨基酸同源性分別為55.8%和47.1%。病毒VP2蛋白氨基酸位點(diǎn)差異結(jié)果顯示從三帶喙庫蚊分離的HN11121病毒與從圓斑按蚊分離的XZ0906相比存在390個(gè)氨基酸差異位點(diǎn)?;贖N11121病毒株VP1基因和VP3基因核苷酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示HN11121屬于環(huán)狀病毒屬西藏環(huán)狀病毒,但是從三帶喙庫蚊分離的HN11121病毒與在圓斑按蚊分離的西藏環(huán)狀病毒原始分離株(XZ0906)處在不同的進(jìn)化分支。以上結(jié)果提示,從三帶喙庫蚊分離的西藏環(huán)狀病毒(HN11121)與從圓斑按蚊分離的西藏環(huán)狀病毒在病毒基因組和病毒基因組分子遺傳進(jìn)化均存在較大差異,鑒于三帶喙庫蚊是我國乙腦病毒的主要傳播媒介,同時(shí)該蚊種也是我國南方廣泛存在的蚊蟲種類,因此加強(qiáng)三帶喙庫蚊中西藏環(huán)狀病毒監(jiān)測對(duì)于了解西藏環(huán)狀病毒的生物多態(tài)性具有重要意義。
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