基于組稀疏的遺傳性疾病和性狀基因位點(diǎn)選擇方法研究
摘要:如何從海量基因信息中高效挖掘出遺傳性疾病密切相關(guān)的基因位點(diǎn)是全基因組關(guān)聯(lián)性分析的核心問題.然而,目前常用的致病基因位點(diǎn)選擇單變量分析技術(shù)不能發(fā)現(xiàn)多基因復(fù)雜交互形成的致病機(jī)制.為此,本文嘗試從多變量分析角度,采用稀疏優(yōu)化模型,實(shí)現(xiàn)致病基因的選擇.為進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)致病基因位點(diǎn)的選擇,采用基于L12范數(shù)的最小組稀疏角回歸算法,通過調(diào)整正則化系數(shù)大小來控制模型的組間稀疏度,最終有效實(shí)現(xiàn)了致病基因和基因位點(diǎn)的選擇.最后,通過某遺傳疾病的真實(shí)基因數(shù)據(jù),驗(yàn)證了該方法的有效性.
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