寧夏2009年腸道病毒71型基因特征分析
摘要：目的 分析2009年寧夏回族自治區手足口病（Hand-Foot-and-Mouth Disease,HFMD）患者中腸道病毒71型（Enterovirus 71,EV71）分離株的基因特征.方法 2009年,從寧夏自治區344例HFMD病例中采集的385份標本,用人橫紋肌肉瘤（Human Rhabdomyosarcoma,RD）細胞對標本進行腸道病毒分離培養;采用型特異性RT-PCR對陽性分離物中的EV71病毒進行鑒定;對鑒定的EV71毒株VP1編碼區進行核苷酸序列測定分析.結果 共分離到腸道病毒126株,其中58株為EV71（46%）,對其中46株EV71的VP1編碼區序列進行測定和分析.寧夏分離株與EV71的A和B基因型代表株核苷酸序列同源性分別為81.7%～82.8%和83.1%～85.2%,氨基酸序列同源性分別為93.9%～95.9%和96.2%～97.9%;與C基因型的C1、C2、C3、C4a、C4b和C5亞型代表株核苷酸序列同源性分別為88.3%～90.6%、88.3%～90.1%、87.8%～89.0%、94.2%～98.9%、91.8%～94.1%和86.7%～89.1%;氨基酸序列同源性分別為97.9%～99.6%、97.9%～99.3%、97.6%～98.9%、97.9%～100%、98.6%～99.6%和97.9%～98.9%.在系統發生樹上,這46株毒株與C4基因型代表株聚為一簇,屬于C4亞型中的C4a分支.結論 2009年EV71的C4a亞型在寧夏有較廣泛的流行,是寧夏流行的絕對優勢基因亞型,C4a也是我國2005年以來流行的優勢基因亞型.
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