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巨桉SuSy基因家族的生物信息學分析

詹妮; 謝耀堅; 陳鴻鵬; 劉果 國家林業局桉樹研究開發中心; 廣東湛江524022

摘要:為了解EgrSuSy 基因家族的生物學功能,從巨桉(Eucalyptus grandis)基因組數據庫中篩選出 18個 SuSy 基因家族成員(EgrSuSy1-EgrSuSy18),采用生物信息學方法對其基因特征與表達模式進行分析.結果表明,EgrSuSy 基因分布在 7 條染色體上,EgrSuSy 蛋白均定位在細胞質膜上,EgrSuSy 家族成員均不具備信號肽.EgrSuSy 蛋白質由 α-螺旋、延伸鏈、無規則卷曲、β-轉角組成.EgrSuSy蛋白與毛果楊(Populus trichocarpa)的 SuSy蛋白親緣關系相近.18 個EgrSuSy 基因在巨桉未成熟木質部、成熟葉片、韌皮部、莖尖、木質部以及幼葉組織中的表達模式不同.因此,EgrSuSy 在巨桉不同組織和發育時期的功能可能存在差異.

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