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橄欖CaICE1基因的克隆和表達分析

賴瑞聯; 陳瑾; 馮新; 程春振; 韋曉霞; 陳義挺; 吳如健 福建省農業科學院果樹研究所; 福州350013; 福建農林大學園藝植物生物工程研究所; 福州350002

摘要：為了解橄欖（Canarium album）抗寒相關轉錄因子 ICE1的調控功能,采用 RT-PCR 技術克隆了‘福欖 1 號’的 ICE1,命名為 CaICE1,并進行生物信息學、qRT-PCR 表達模式和相關 miRNA預測分析.結果表明,CaICE1 cDNA序列的開放閱讀框長度為 1 650 bp,可編碼549個氨基酸（GenBank登錄號 MG459422）.CaICE1 為不穩定親水性蛋白質,含有跨膜結構、磷酸化位點以及 HLH 保守結構域,定位于細胞核,與枳的 ICE1 親緣關系較近.CaICE1 密碼子偏好性較弱,AGA、AGG、TGG和 CCA可能為其最優密碼子群.CaICE1 主要在橄欖花、種子和葉中大量表達,-3℃低溫脅迫下 CaICE1 表達水平比常溫顯著上升. psRNAtarget 預測結果表明, CaICE1 可能是 miR825、 miR477、 miR5658、 miR1436 和miR394 等多個逆境響應 miRNA的靶基因.因此,CaICE1 可能在橄欖低溫脅迫過程中發揮重要調控作用,且可能受 miRNA的調控.

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