大鼠C6腦膠質瘤模型的基因表達譜分析
摘要：目的：篩選和分析大鼠膠質瘤模型與正常星型膠質細胞中的差異表達基因。方法：構建大鼠C6顱內膠質瘤模型,利用Illumina Hi Seq 4000技術對大鼠膠質瘤模型的膠質細胞和正常星形膠質細胞進行轉錄組測序并對測序結果進行功能注釋。以q值〈0. 05為標準篩選差異表達基因,并通過GO和KEGG數據庫分析其功能和參與的信號通路。結果：較之正常星形膠質細胞,大鼠膠質瘤模型組細胞共篩選得到9221個差異表達基因,其中4604個基因表達上調,4617個基因表達下調; GO富集結果表明：這些差異表達基因共映射到575個GO term,與各類結合相關的分子如蛋白結合、離子結合、小分子結合、核苷酸結合等功能富集顯著; KEGG富集結果表明：差異表達基因共參與22條通路,富集最多的是癌癥發生通路、MAPK通路、胞吞通路和黏著斑通路。結論：成功獲取大鼠膠質瘤模型細胞與正常膠質細胞的基因表達譜,差異表達基因富集在癌癥發生通路、MAPK通路、胞吞作用通路和黏著斑等生物學通路,這些信號通路可能在膠質瘤發生發展過程中發揮重要作用,對其進一步分析將為臨床治療膠質瘤提供新的靶點。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系神經解剖學雜志社
相關推薦
更多
