多位點(diǎn)序列分型技術(shù)在熱帶念珠菌中的應(yīng)用研究
摘要:目的探討上海瑞金醫(yī)院臨床分離的熱帶念珠菌MLST (Multilocus sequence types,MLST)型別。方法連續(xù)收集上海市瑞金醫(yī)院臨床分離的熱帶念珠菌菌株,用PCR技術(shù)擴(kuò)增熱帶念珠菌的6對(duì)管家基因,并對(duì)擴(kuò)增片段進(jìn)行純化測序后與熱帶念珠菌MLST數(shù)據(jù)庫比對(duì)得到臨床菌株的二倍體序列型別DSTs (Diploid sequence types,DSTs),再利用eBURST V3軟件對(duì)結(jié)果進(jìn)行分析,用MEGA 6.0軟件建立系統(tǒng)發(fā)育樹,最后對(duì)部分臨床菌株進(jìn)行藥物敏感性實(shí)驗(yàn),探討菌株耐藥與基因型別之間的關(guān)系。結(jié)果臨床分離的92株熱帶念珠菌分屬于47個(gè)DSTs,其中15個(gè)DSTs是已經(jīng)報(bào)道的,32個(gè)DSTs在本次研究中首次得到;DST507和DST376是本次研究中的優(yōu)勢型別,且屬于同一個(gè)克隆簇。藥敏實(shí)驗(yàn)顯示屬于優(yōu)勢型別的27株臨床菌株中21株為唑類藥物耐藥菌株。結(jié)論 MLST技術(shù)是一種高效的基因分型技術(shù);DST507和DST376是上海瑞金醫(yī)院熱帶念珠菌的優(yōu)勢型別;唑類藥物耐藥菌株表現(xiàn)為DST507和DST376的聚集分布。
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