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RNA-Seq定量分析鹽膚木對鉛脅迫的響應

夏麗丹; 張虹; 胡華英; 曹升; 周垂帆 福建農林大學林學院; 福州350002; 海峽兩岸水土保持協同創新中心; 福州350002; 福建長汀紅壤丘陵生態系統國家定位觀測研究站; 福州350002

摘要:為探究重金屬污染地生態修復先鋒植物——鹽膚木對重金屬脅迫的分子響應機制,設置3個鉛脅迫水平(0、250、1000mg·kg^-1),應用Illumina HiSeqTM 2000進行鹽膚木根系的轉錄組測序,并通過Gene Ontology(GO)與Pathway功能顯著富集分析方法,分析說明鹽膚木響應不同鉛脅迫水平下的差異表達基因。結果表明,鹽膚木在遭受輕度鉛脅迫時,主要有4類水解酶與2類磷酸酶相關基因顯著富集,說明鹽膚木主要通過調節細胞內水解酶與磷酸酶相關基因來抵御脅迫,而在重度鉛脅迫下,主要有6類氧化還原酶相關基因出現顯著富集,此時氧化還原酶相關基因起到主要調節作用;鹽膚木在鉛脅迫下細胞受損,在輕、重度鉛脅迫下,分別有24、16類細胞相關基因顯著富集,但其自身可通過調節細胞內細胞器、細胞質等相關的細胞運動以應對逆境;核糖體代謝通路是鹽膚木適應鉛脅迫的主要代謝通路。研究表明,核糖體相關基因是鹽膚木響應鉛脅迫的主要應答與調節基因。

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