PEG模擬干旱脅迫下野生大豆轉(zhuǎn)錄組分析
摘要:為研究耐旱型野生大豆在干旱脅迫下基因表達(dá)譜的變化,從備選野生大豆材料中篩選抗旱性強(qiáng)的野生大豆品種,同時(shí)探討最適PEG脅迫濃度,而后以野生大豆永46為試驗(yàn)材料,利用RNA-seq技術(shù)對(duì)20%PEG6000處理不同時(shí)間的葉片進(jìn)行基因表達(dá)譜差異分析。結(jié)果顯示:獲得39 183個(gè)序列信息,其中各時(shí)期共有序列27 875個(gè)。隨干旱脅迫時(shí)間延長(zhǎng),差異表達(dá)基因數(shù)量發(fā)生變化,脅迫12 h達(dá)到最多。根據(jù)GO功能分析可將序列大致分為分子功能、細(xì)胞成分和生物學(xué)過(guò)程三大類,其差異表達(dá)基因廣泛涉及糖、脂類、蛋白質(zhì)和核酸等生物大分子代謝、能量代謝以及次生代謝過(guò)程。在KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中,依據(jù)代謝途徑可將其定位在127個(gè)分支,包括植物-病原體互作、植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、RNA降解、ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白等,其中植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑在不同時(shí)間處理下的變化都顯著。轉(zhuǎn)錄因子分析發(fā)現(xiàn)在干旱脅迫下變化明顯的轉(zhuǎn)錄因子家族包括MYB、bHLH、AP2/EREBP、WRKY和NAC等。對(duì)4個(gè)不同功能基因干旱脅迫后不同時(shí)間的表達(dá)量進(jìn)行熒光定量分析,其變化趨勢(shì)與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)相同。
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