基于葉綠體DNA atp B-rbc L片段的典型櫻亞屬部分種的親緣關系及分類地位探討
摘要：薔薇科典型櫻亞屬植物(Subg.Cerasus Koehne)(櫻花類)具有重要的觀賞價值,深入研究其種間親緣關系及分類地位,對于國產櫻屬植物系統發育與種質資源創新具有重要的理論指導意義。基于PCR擴增與測序技術研究了從云南、江西、福建采集的典型櫻亞屬3個種(含變種)的葉綠體DNA非編碼區atp B-rbc L片段,結合GenBank數據庫已經提交的其它4個種的同源序列,共獲得7個種的30條序列矩陣,以此構建了單倍型中介網絡圖與系統發育樹,分析和探討了它們的親緣關系與分類地位。(1)在atp B-rbc L序列矩陣中,774個有效位點中共發現15個多態性位點,占分析序列的1.94%,(A+T)含量為70.50%,存在明顯的堿基偏好;(2)DNASP 5共檢測到9個單倍型,物種間平均單倍型多樣性(H d=0.880 5±0.026),平均核苷酸多態性(π=0.007 11±0.000 54),除尾葉櫻桃(Prunus dielsiana)外(Hap5~Hap7),其余物種擁有各自獨特的1個單倍型,具有較豐富的遺傳多樣性;(3)綜合Network中介圖與系統發育重建結果:推測磐安櫻桃(P.pananensis)處于較原始的進化階段,相比尾葉櫻桃,與浙閩櫻桃(P.schneideriana)親緣關系較近;長柱尾葉櫻桃(P.dielsiana var.longistyla)與尾葉櫻桃互為姊妹支,并共同構成獨立進化單元。綜上,葉綠體atp B-rbc L片段在典型櫻亞屬下種間的適用效果較好,可以優先選為DNA條形碼;分子證據結合形態學特征支持將長柱尾葉櫻桃作為尾葉櫻桃變種的處理意見,而磐安櫻桃的分類地位則需要更多的證據。
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