基于轉錄組測序技術篩選花[魚骨]卵巢發育相關基因
摘要：為篩選影響花[魚骨]卵巢發育相關的基因,采用Illumina Hiseq技術對花[魚骨]腦、卵巢和肝臟組織進行高通量轉錄組測序。結果顯示,3個組織分別產生了49 484 132、47 540 538和50 622 304個clean reads,組裝后共獲得了99 878個unigenes,平均長度為1 430 bp。DE seq分析發現,在腦vs.卵巢組中特異性表達的基因數為2 305個,腦vs.肝臟組中特異性表達的基因數為839個,卵巢vs.肝臟組中特異性表達的基因數為1 474個,3個比較組共有的差異表達基因數為860個。GO分析發現,上述差異表達基因主要集中在初級代謝過程(primary metabolic process)、單細胞過程(single-organism process)、有機物代謝過程(organic substance metabolic process)等生物學過程中。KEGG pathway分析顯示,一些與卵巢發育和減數分裂相關的信號通路得到了顯著富集,如GnRH信號通路、類固醇激素合成、TGF-β信號通路、卵母細胞減數分裂等代謝通路。本研究結果豐富了花[魚骨]的基因資源,可為花[魚骨]的繁殖生物學研究提供基礎數據。
注: 保護知識產權,如需閱讀全文請聯系水產學報雜志社
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