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DEL cDNA序列分析及蛋白質三維結構的模建

莊乃保 張印則 吳凡 邵超鵬 蘇曉東 深圳市血液中心 深圳518035 北京大學 北京100000

摘要:目的 分析DEL血型的cDNA序列,模擬并分析DEL血型蛋白質三維結構.方法 采用逆轉錄-聚合酶鏈反應(RT-PCR)技術和cDNA序列分析技術,得到DEL血型的cDNA序列并測序分析.通過同源比較模建(Homology comparative modeling)的思想,構建和分析正常陽性RHD和DEL9兩種蛋白質的三維結構.結果 DEL血型個體有復雜的mRNA形式,共檢測到6種形式的RhD轉錄子.DEL血型不存在正常的RhD mRNA.對正常RHD和與正常RHD序列相似度最高的DEL9蛋白質結構進行比較分析.結構顯示DEL9蛋白屬于α螺旋結構蛋白,其在膜外部分與正常RhD蛋白基本一致.結論 DEL血型可能具有正常RhD的抗原表位.

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