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梅花鹿茸生長中心軟骨組織差異基因表達分析

劉美欣; 趙雨; 張梅; 劉宇昕; 胡耀中; 幺寶金 長春中醫藥大學中醫藥與生物工程研究開發中心; 長春130117; 長春中醫藥大學創新實踐中心; 長春130117

摘要:旨在研究不同生長時期東北梅花鹿茸生長中心軟骨組織基因表達變化,為鹿茸快速生長機制研究提供理論依據。采用Illumina測序技術和生物信息學方法對快速生長期和骨化期鹿茸生長中心軟骨組織進行轉錄組測序、組裝、比對和差異基因表達分析。從快速生長期和骨化期鹿茸軟骨組織中分別獲得4.47和4.45 Gb的測序數據,測序質量值Q 20值分別為98.44和98.05。通過Trinity軟件組裝,分別獲得39377和37331條組裝序列,平均長度分別為1138和1143 nt,通過與蛋白數據庫進行比對和差異基因表達分析篩選出調控鹿茸快速生長和骨化的差異表達生長因子7種,差異表達轉錄因子12種和差異表達膠原8種。本研究結果為鹿茸快速生長及骨化機制研究提供理論基礎。

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