利用RNA-Seq技術(shù)篩選腦血流自動(dòng)調(diào)節(jié)相關(guān)基因
摘要:目的利用RNA-Seq技術(shù)篩選并分析與腦血流自動(dòng)調(diào)節(jié)相關(guān)的基因。方法健康雄性SD大鼠隨機(jī)分為高血壓模型組(14只)和假手術(shù)組(6只),高血壓模型組大鼠進(jìn)行雙側(cè)腎動(dòng)脈夾閉,假手術(shù)組行開(kāi)腹手術(shù),不夾閉腎動(dòng)脈。術(shù)后8周將大鼠麻醉,以10~15 mm Hg為一級(jí)降低血壓,同步記錄股動(dòng)脈血壓、頸動(dòng)脈血流量以及大腦中動(dòng)脈血流速度,繪制自動(dòng)調(diào)節(jié)曲線,并計(jì)算腦血流自動(dòng)調(diào)節(jié)下限(lower limit of autoregulation,LLCA)。其后取大鼠腦組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA sequencing,RNA-Seq),比較兩組基因表達(dá)差異。根據(jù)LLCA升高程度將模型組分為兩個(gè)亞組,高LLCA亞組與低LLCA亞組,高LLCA與假手術(shù)組篩選差異表達(dá)基因。結(jié)果完整采集數(shù)據(jù)模型組6只,假手術(shù)組3只。模型組收縮壓、平均動(dòng)脈壓以及LLCA均顯著高于假手術(shù)組(P〈0.05)。模型組中高LLCA亞組與低LLCA亞組收縮壓、平均動(dòng)脈均無(wú)明顯差異,但高LLCA組的LLCA值高于低LLCA組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P〈0.05)。模型組與假手術(shù)組相比有45條基因差異表達(dá),其中上調(diào)基因30條,下調(diào)基因15條,高LLCA亞組與假手術(shù)組比較有478條基因差異表達(dá),其中上調(diào)基因289條,下調(diào)基因189條。兩兩比較的交集差異基因共有38條,功能主要涉及趨化作用、平滑肌細(xì)胞分化、肌管細(xì)胞發(fā)育、整聯(lián)蛋白介導(dǎo)的信號(hào)通路等。結(jié)論高血壓大鼠與正常大鼠共有45條基因差異表達(dá),其中高LLCA的高血壓大鼠有478條基因表達(dá)發(fā)生變化。
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