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不同RNA提取方法的效能比較

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摘要:目的比較7種不同的RNA提取方法(6種商業化試劑盒加Trizol有機提取法)的相對提取效率,為法醫實踐中選擇提取高質量的RNA/miRNA提供參考。方法分別使用6種不同的商業化試劑盒以及Trizol有機提取法提取晾干的外周血棉簽樣本,通過對RNA進行紫外熒光定量檢測、瓊脂糖凝膠電泳檢測和測定樣本中內參基因RNU6b的相對含量等方式進行評價。結果各試劑盒所提RNA/miRNA的質量評估和表達分析結果有明顯差異,其中Trizol有機提取法和試劑盒RNeasy^■Mini可以得到更高質量和純度的RNA/miRNA,170μL外周血中所提取的RNA總量可達到(3860.50±182.12)ng、純度(OD260/280)約為1.84±0.03,且瓊脂糖電泳結果顯示RNA完整性好,在后續實驗中表現良好。結論在所有的提取方法中,綜合考慮RNA的數量、質量以及RealtimePCR檢測結果,更適合提取外周血RNA的方法為RNeasy^■MiniKit和Trizol有機提取法。

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